核酸染料是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中重要的工具,廣泛應(yīng)用于瓊脂糖凝膠電泳等核酸檢測(cè)場(chǎng)景,其核心作用是與核酸特異性結(jié)合并發(fā)出熒光,實(shí)現(xiàn)核酸條帶的可視化。掌握科學(xué)的使用技巧并嚴(yán)格遵守注意事項(xiàng),不僅能保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,還能保障實(shí)驗(yàn)人員的安全。
在使用技巧方面,首先要做好染料的選擇與配比。不同核酸染料的結(jié)合效率、熒光強(qiáng)度、毒性及適用場(chǎng)景存在差異,需根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求合理挑選。例如,SYBRGreenI適用于雙鏈DNA的常規(guī)檢測(cè),靈敏度較高;EB(溴化乙錠)雖經(jīng)典但毒性較強(qiáng),目前已逐漸被低毒染料替代。配比時(shí)需嚴(yán)格遵循說(shuō)明書(shū),精準(zhǔn)控制染料濃度——濃度過(guò)高易導(dǎo)致背景熒光過(guò)強(qiáng),掩蓋目標(biāo)條帶;濃度過(guò)低則熒光信號(hào)微弱,無(wú)法清晰成像。建議采用“凝膠內(nèi)加樣”或“電泳后染色”兩種方式,凝膠內(nèi)加樣可簡(jiǎn)化操作流程,電泳后染色則能減少染料對(duì)核酸遷移率的影響,可根據(jù)實(shí)驗(yàn)精度要求選擇。
其次,要把控好染色與顯影的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。若采用電泳后染色,需將凝膠放入稀釋后的染料溶液中浸泡,浸泡時(shí)間通常為10-30分鐘,期間可輕輕晃動(dòng)容器,確保染料與核酸充分結(jié)合。對(duì)于厚膠或高濃度凝膠,應(yīng)適當(dāng)延長(zhǎng)浸泡時(shí)間。顯影時(shí),需根據(jù)染料的熒光激發(fā)波長(zhǎng)選擇對(duì)應(yīng)的光源,避免激發(fā)波長(zhǎng)不匹配導(dǎo)致熒光信號(hào)衰減。同時(shí),要控制曝光時(shí)間,短曝光可減少背景干擾,長(zhǎng)曝光則能增強(qiáng)弱條帶的可見(jiàn)度,需通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)找到最佳曝光參數(shù)。
注意事項(xiàng)是實(shí)驗(yàn)安全與結(jié)果可靠的重要保障。第一,嚴(yán)格做好防護(hù)措施。多數(shù)核酸染料具有毒性,部分還可能致癌,實(shí)驗(yàn)時(shí)需佩戴一次性手套、口罩和實(shí)驗(yàn)服,避免直接接觸皮膚和呼吸道。若染料不慎沾染皮膚,應(yīng)立即用大量清水沖洗;若不慎誤食或吸入,需及時(shí)就醫(yī)。第二,規(guī)范處理實(shí)驗(yàn)廢棄物。染液、染色后的凝膠及相關(guān)耗材均屬于危險(xiǎn)廢棄物,不可隨意丟棄,需收集到專用的有害廢棄物容器中,交由專業(yè)機(jī)構(gòu)處理,防止污染環(huán)境。
第三,注重染料的儲(chǔ)存與穩(wěn)定性。核酸染料多對(duì)光敏感,需密封保存在避光、低溫環(huán)境中,避免光照和高溫導(dǎo)致染料降解,影響使用效果。同時(shí),要注意染料的保質(zhì)期,過(guò)期染料可能出現(xiàn)熒光強(qiáng)度下降、特異性降低等問(wèn)題,應(yīng)及時(shí)更換。第四,避免干擾因素影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需使用無(wú)核酸酶的耗材,防止核酸降解;染色容器需清潔干凈,避免殘留雜質(zhì)與染料結(jié)合,產(chǎn)生假陽(yáng)性信號(hào)。